81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0851 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  83.61 
 
 
318 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  83.06 
 
 
322 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0910  hypothetical protein  45.74 
 
 
298 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190788  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  41.3 
 
 
214 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  40.2 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  28.37 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  32.39 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  30.77 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  29.77 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  35.07 
 
 
204 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  34.78 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  34.48 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  29.92 
 
 
208 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  34.48 
 
 
203 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  35.33 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  34.67 
 
 
204 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  35.38 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  35.33 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  33.09 
 
 
167 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  33.58 
 
 
173 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  34.13 
 
 
192 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  31.21 
 
 
179 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  27.37 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  30.53 
 
 
166 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  28.5 
 
 
190 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  32.12 
 
 
179 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  29.1 
 
 
214 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  28.89 
 
 
208 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  29.5 
 
 
176 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  33.33 
 
 
179 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  28.36 
 
 
214 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  29.63 
 
 
201 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  29.27 
 
 
169 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  28.24 
 
 
166 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  29.77 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  30.6 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  27.84 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  28.46 
 
 
170 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  32.35 
 
 
182 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  28.68 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  28.68 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  31.53 
 
 
183 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  24.83 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  23.53 
 
 
200 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  26.32 
 
 
172 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0882  hypothetical protein  26.63 
 
 
218 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  27.86 
 
 
178 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  29.92 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0930  hypothetical protein  26.74 
 
 
219 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  34.19 
 
 
181 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  27.82 
 
 
176 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  28.68 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  29.71 
 
 
172 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0933  hypothetical protein  26.49 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.085058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  30.23 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  31.93 
 
 
180 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  28.79 
 
 
181 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  28.79 
 
 
181 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  31.87 
 
 
178 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  29.17 
 
 
175 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  30.08 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  27.43 
 
 
985 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  31.58 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  27.94 
 
 
190 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2512  hypothetical protein  30.58 
 
 
363 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0253477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2966  hypothetical protein  28.07 
 
 
174 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204675  normal  0.0956768 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  25.38 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  25.93 
 
 
173 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  27.86 
 
 
191 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  27.21 
 
 
195 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  27.21 
 
 
175 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>