More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0845 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  98.17 
 
 
437 aa  827  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
437 aa  843  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  97.95 
 
 
439 aa  793  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  65.53 
 
 
437 aa  505  1e-142  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  47.18 
 
 
447 aa  340  3e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  44.02 
 
 
446 aa  338  2e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  42.3 
 
 
440 aa  308  1e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  42.62 
 
 
445 aa  307  2e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  34.87 
 
 
475 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  45.5 
 
 
454 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  38.13 
 
 
428 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  36.23 
 
 
439 aa  286  6e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  37.12 
 
 
441 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  40.1 
 
 
447 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  40.98 
 
 
442 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  40.73 
 
 
441 aa  279  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  42.29 
 
 
437 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  37.34 
 
 
428 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  38.7 
 
 
451 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  7.88125e-08 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  33.96 
 
 
437 aa  273  4e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  39 
 
 
445 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  33.09 
 
 
438 aa  267  3e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  36.68 
 
 
426 aa  266  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  35.68 
 
 
426 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  41.4 
 
 
446 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  35.61 
 
 
433 aa  256  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  37.82 
 
 
454 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  35.33 
 
 
425 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  41.58 
 
 
434 aa  250  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.8 
 
 
439 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  38.77 
 
 
459 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  35.8 
 
 
453 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  37.32 
 
 
428 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  36.84 
 
 
444 aa  246  7e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  37.04 
 
 
455 aa  246  7e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  37.04 
 
 
455 aa  246  7e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  34.83 
 
 
454 aa  245  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  35.68 
 
 
436 aa  245  1e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  36.71 
 
 
439 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  40.77 
 
 
430 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  43.05 
 
 
399 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  36.5 
 
 
448 aa  233  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  35.34 
 
 
447 aa  233  7e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  38.58 
 
 
467 aa  232  8e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  30.94 
 
 
439 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  39.04 
 
 
441 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  39.33 
 
 
446 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  36.17 
 
 
440 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  34.81 
 
 
441 aa  221  2e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  36.63 
 
 
444 aa  213  5e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  38.89 
 
 
442 aa  213  8e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  35.01 
 
 
437 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  36.88 
 
 
440 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  36.9 
 
 
440 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.02 
 
 
453 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  38.93 
 
 
420 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  36.9 
 
 
440 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  34.69 
 
 
424 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  34.27 
 
 
426 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  36.99 
 
 
440 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  32.1 
 
 
434 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  34.69 
 
 
424 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  35.31 
 
 
437 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  36.21 
 
 
422 aa  201  2e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  34.59 
 
 
440 aa  200  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  34.66 
 
 
439 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  35.61 
 
 
424 aa  199  1e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  30.96 
 
 
434 aa  198  1e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  35.1 
 
 
437 aa  198  2e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.07 
 
 
423 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06248e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  32.99 
 
 
418 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  35.73 
 
 
422 aa  197  4e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.51 
 
 
448 aa  196  5e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  32.5 
 
 
423 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.58 
 
 
423 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  32.5 
 
 
423 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.58 
 
 
423 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.34 
 
 
448 aa  196  8e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.32 
 
 
423 aa  196  8e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06713e-09 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.32 
 
 
423 aa  196  8e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.32 
 
 
423 aa  196  8e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  3.49756e-08 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  33.57 
 
 
445 aa  196  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.24 
 
 
423 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.82 
 
 
423 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.84 
 
 
423 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  33.57 
 
 
425 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.58 
 
 
423 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  4.29728e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 
423 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.5 
 
 
423 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  36.71 
 
 
439 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  35.45 
 
 
422 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  37.96 
 
 
420 aa  191  3e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.24 
 
 
423 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  3.15224e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  35.96 
 
 
435 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  37.96 
 
 
448 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  32.09 
 
 
419 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  1.91252e-09 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.62 
 
 
441 aa  185  1e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  33.67 
 
 
430 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  32.45 
 
 
430 aa  182  8e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.39 
 
 
441 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>