More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0752 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  100 
 
 
291 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  91.16 
 
 
294 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  88.36 
 
 
292 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  61.57 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  40.59 
 
 
323 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  37.45 
 
 
427 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  37.45 
 
 
427 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  39.58 
 
 
464 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  41 
 
 
484 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  37.5 
 
 
412 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.37 
 
 
283 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  33.06 
 
 
274 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  31.37 
 
 
582 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  37.92 
 
 
419 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  54.69 
 
 
751 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  39.92 
 
 
478 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  31.23 
 
 
452 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  34.6 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  39.04 
 
 
284 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  36.78 
 
 
471 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  36.86 
 
 
530 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  35.22 
 
 
279 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  36.71 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  39.42 
 
 
474 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  53.24 
 
 
727 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  36.36 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  52.94 
 
 
824 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  53.24 
 
 
727 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  35.96 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  37.89 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  35.74 
 
 
534 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  33.47 
 
 
438 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  31.4 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  34.02 
 
 
509 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  53.96 
 
 
195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  34.9 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  51.26 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  35.51 
 
 
430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  36.14 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  50.42 
 
 
198 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  53.78 
 
 
590 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  52.54 
 
 
449 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  36.02 
 
 
394 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.2 
 
 
271 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  50.85 
 
 
333 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0370  peptidase M23B  32.09 
 
 
376 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  33.22 
 
 
252 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  32.54 
 
 
288 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  52.54 
 
 
453 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.45 
 
 
285 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.99 
 
 
288 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 
349 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  35.98 
 
 
538 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  39.42 
 
 
261 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  32.81 
 
 
271 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  36.25 
 
 
402 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  31.71 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  31.83 
 
 
374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  29.6 
 
 
509 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  34.83 
 
 
262 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  52.89 
 
 
754 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.08 
 
 
388 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  35.05 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  54.2 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  33.89 
 
 
297 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  32.16 
 
 
448 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  46.67 
 
 
465 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.64 
 
 
411 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  48.06 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  47.58 
 
 
482 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  30.23 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50.43 
 
 
455 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50.43 
 
 
451 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  37.1 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  30.98 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  31.98 
 
 
250 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  50.43 
 
 
446 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  32.93 
 
 
265 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.58 
 
 
305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  31.98 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  31.98 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  31.98 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  35.56 
 
 
358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  31.98 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  53.33 
 
 
348 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  57.14 
 
 
376 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  55.17 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  33.09 
 
 
445 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  31.98 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  31.02 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  47.97 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.9 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32.2 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.97 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  32.2 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.9 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  32.2 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  32.2 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  49.53 
 
 
491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  28.4 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>