More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0278 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  100 
 
 		 283 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  97.43 
 
 		 283 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  96.69 
 
 		 283 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  79 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.08 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  49.5 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  57.78 
 
 		 201 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  58.33 
 
 		 201 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  57.78 
 
 		 207 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  55.49 
 
 		 217 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  43.61 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  54.95 
 
 		 218 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  44.54 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  54.12 
 
 		 208 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  39.84 
 
 		 256 aa  192  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  40.61 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  38.19 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.78 
 
 		 199 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 207 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 213 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 256 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  52.63 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  57.38 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  42 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  38.8 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.17 
 
 		 214 aa  183  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  54.85 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  40.73 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  51.89 
 
 		 198 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  50.82 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  51.89 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  45.53 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 211 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50 
 
 		 202 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50 
 
 		 202 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  52.78 
 
 		 201 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  50 
 
 		 205 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 257 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  52.25 
 
 		 191 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  49.24 
 
 		 203 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  53.63 
 
 		 208 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  49.2 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 199 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  50 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  54.19 
 
 		 202 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 211 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  43.6 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 198 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 212 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  54.12 
 
 		 203 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  36.86 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 191 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 218 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  53.07 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  51.05 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 212 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 191 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  50.25 
 
 		 206 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>