More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0273 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 343 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 314 aa  613  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  87.76 
 
 		 315 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  72.6 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  70.78 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  71.23 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  70.32 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  70.32 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  72.6 
 
 		 251 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  65.81 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  67.26 
 
 		 304 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  67.81 
 
 		 257 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  68.04 
 
 		 257 aa  322  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  68.04 
 
 		 301 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  67.73 
 
 		 232 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  64.55 
 
 		 248 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  67.12 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  66.36 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  64.04 
 
 		 235 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  58.73 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  62.61 
 
 		 262 aa  311  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  61.28 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  65.45 
 
 		 233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  65.45 
 
 		 233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  65 
 
 		 244 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 233 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  65.3 
 
 		 235 aa  308  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  63.01 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  63.47 
 
 		 254 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  63.51 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  62.72 
 
 		 235 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  59.18 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  64.38 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  63.64 
 
 		 260 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  65.45 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  64.09 
 
 		 233 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  63.01 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  62.95 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  63.64 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  62.73 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  62.1 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  62.73 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  62.27 
 
 		 244 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  61.36 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  64.09 
 
 		 236 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0346  30S ribosomal protein S2  65 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  61.95 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  60.91 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  63.35 
 
 		 233 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  63.35 
 
 		 233 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  59.55 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  61.19 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  61.36 
 
 		 232 aa  292  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  55.6 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  58.26 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  55.6 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  58.2 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3161  30S ribosomal protein S2  58.72 
 
 		 242 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  59.55 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  58.72 
 
 		 242 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 255 aa  288  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  63.64 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2885  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 242 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000206646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  59.55 
 
 		 260 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  58.72 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  55.84 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2902  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 242 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000838626  normal  0.171153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 242 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 242 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1481  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 242 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000136329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1629  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2641  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2708  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000765128  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2815  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  59.09 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1348  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  58.97 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  56.28 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  62.1 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  60 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1270  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00260886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2635  30S ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 242 aa  281  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253973  normal  0.214401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  59.36 
 
 		 296 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  56.45 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  59.82 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  56.56 
 
 		 250 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>