More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0250 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  60.16 
 
 
516 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  59.57 
 
 
516 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  60.73 
 
 
518 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  61.14 
 
 
517 aa  653    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.18 
 
 
510 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  63.26 
 
 
529 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.16 
 
 
537 aa  655    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  64.1 
 
 
510 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  63.41 
 
 
510 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  63.58 
 
 
551 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  86.21 
 
 
520 aa  925    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  62.6 
 
 
511 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  63.12 
 
 
510 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  61.99 
 
 
534 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  61.54 
 
 
515 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  64.59 
 
 
519 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.52 
 
 
510 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  60.89 
 
 
513 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  61.87 
 
 
513 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  62.72 
 
 
510 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  100 
 
 
519 aa  1051    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  67.81 
 
 
531 aa  692    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  63.22 
 
 
512 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  63.22 
 
 
531 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  67.48 
 
 
516 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  67 
 
 
513 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  61.34 
 
 
515 aa  638    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  61.15 
 
 
536 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  61.89 
 
 
513 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  62.01 
 
 
508 aa  649    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  62.43 
 
 
510 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  63.41 
 
 
510 aa  672    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  64.5 
 
 
510 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  63.46 
 
 
522 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  99.23 
 
 
519 aa  1046    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  67.64 
 
 
528 aa  719    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  65.48 
 
 
516 aa  690    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  62.67 
 
 
510 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  62.75 
 
 
510 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  64.89 
 
 
530 aa  668    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  98.84 
 
 
519 aa  1041    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  61.21 
 
 
510 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  61.08 
 
 
518 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  66.99 
 
 
550 aa  696    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  58.78 
 
 
516 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  61.01 
 
 
510 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  64.38 
 
 
514 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  61.79 
 
 
510 aa  656    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  60.43 
 
 
513 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  63.31 
 
 
514 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  63.12 
 
 
510 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  66.67 
 
 
516 aa  685    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  64.57 
 
 
530 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  62.8 
 
 
510 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  61.88 
 
 
510 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  64.4 
 
 
510 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  61.4 
 
 
510 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  60.93 
 
 
540 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  58.56 
 
 
513 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  60.82 
 
 
531 aa  645    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  59.37 
 
 
516 aa  644    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  60.82 
 
 
510 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  69.57 
 
 
516 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  69.53 
 
 
516 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  61.99 
 
 
510 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  62.55 
 
 
510 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  63.91 
 
 
510 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  63.16 
 
 
510 aa  673    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  63.6 
 
 
510 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  64.2 
 
 
510 aa  668    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  63.71 
 
 
510 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  60.83 
 
 
516 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  62.52 
 
 
510 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  62.62 
 
 
510 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  64.17 
 
 
522 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  61.93 
 
 
516 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  66.8 
 
 
516 aa  662    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  63.09 
 
 
510 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  61.79 
 
 
527 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  70.96 
 
 
520 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  61.4 
 
 
510 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  61.99 
 
 
527 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  59.08 
 
 
508 aa  634  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  61.69 
 
 
508 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  60.86 
 
 
510 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  62.33 
 
 
536 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  61.12 
 
 
546 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  59.84 
 
 
510 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  60.39 
 
 
517 aa  628  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  61.01 
 
 
523 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  58.17 
 
 
564 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  58.38 
 
 
514 aa  630  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  60.04 
 
 
510 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  59.48 
 
 
517 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  61.65 
 
 
514 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  61.18 
 
 
510 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  59.45 
 
 
510 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  60.95 
 
 
510 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  62.13 
 
 
510 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  59.65 
 
 
510 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>