289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0233 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  294  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  96.73 
 
 		 153 aa  287  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  96.08 
 
 		 153 aa  285  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  81.7 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  37.42 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  42.77 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  45.81 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  45.16 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  39.38 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  43.59 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  36.77 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  42.58 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  41.29 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  41.94 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.36 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  40.38 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  39.75 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  39.13 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  38.04 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3822  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  44.59 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  36.77 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  42.21 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  41.56 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  45.62 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  43.95 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  43.59 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2527  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  39.35 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1137  protein of unknown function DUF163  43.51 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240121  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>