More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0170 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  95.03 
 
 
382 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  95.03 
 
 
382 aa  678    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 
382 aa  756    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  77.37 
 
 
382 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  47.03 
 
 
385 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  39.46 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  40.36 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  39.51 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.1 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  36.02 
 
 
385 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.74 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  41.07 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  37.43 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  36.18 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  36.18 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  37.1 
 
 
372 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  35.47 
 
 
388 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.3 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.6 
 
 
363 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  32.49 
 
 
376 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  32.8 
 
 
394 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  36.07 
 
 
378 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  31.58 
 
 
408 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  33.22 
 
 
374 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  35.45 
 
 
389 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  34.32 
 
 
372 aa  159  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  37.42 
 
 
391 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  32.57 
 
 
374 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  39.46 
 
 
420 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  35.79 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  36.68 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  30.43 
 
 
409 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  29.54 
 
 
413 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  29.27 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  37.7 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  33.87 
 
 
376 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  36.39 
 
 
376 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  32.73 
 
 
376 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  30.9 
 
 
432 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  37.03 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  34.55 
 
 
376 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  38.94 
 
 
381 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  32.98 
 
 
376 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  36.07 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  34.77 
 
 
376 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  38.24 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  36.41 
 
 
391 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  40 
 
 
412 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  28.24 
 
 
436 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.02 
 
 
436 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  29.02 
 
 
436 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.03 
 
 
416 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  28.46 
 
 
438 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  34.86 
 
 
375 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  28.54 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  30.19 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.03 
 
 
407 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  30.05 
 
 
429 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  29.23 
 
 
410 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  35.28 
 
 
405 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  29.23 
 
 
432 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  30.77 
 
 
418 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.86 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.86 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  28.99 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  29.78 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  31.17 
 
 
423 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.54 
 
 
412 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.22 
 
 
428 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.22 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  32.18 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  29.04 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  30.64 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  33.59 
 
 
402 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  27.61 
 
 
424 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.79 
 
 
376 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  28.34 
 
 
417 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  32.36 
 
 
401 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  34.24 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.71 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  26.34 
 
 
422 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  28.17 
 
 
436 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  32 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  18.42 
 
 
743 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  25.41 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  27.07 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  22.86 
 
 
422 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.47 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  28.48 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.24 
 
 
463 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.35 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.17 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  30.05 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  28.76 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 
432 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>