More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0085 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  43.17 
 
 		 1173 aa  843    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  44.17 
 
 		 1169 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  45.72 
 
 		 1151 aa  843    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  36.24 
 
 		 1187 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.15 
 
 		 1132 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  41.33 
 
 		 1183 aa  855    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  52.47 
 
 		 1180 aa  1171    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.9 
 
 		 1132 aa  718    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.9 
 
 		 1133 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.09 
 
 		 1133 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  97.3 
 
 		 1150 aa  2190    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  40.92 
 
 		 1191 aa  854    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  44.71 
 
 		 1158 aa  891    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  38.49 
 
 		 1182 aa  817    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  43.44 
 
 		 1168 aa  821    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.24 
 
 		 1132 aa  727    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  41.14 
 
 		 1178 aa  827    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  43.55 
 
 		 1215 aa  865    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  41.23 
 
 		 1214 aa  760    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  39.4 
 
 		 1176 aa  810    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  38.46 
 
 		 1214 aa  778    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  44.42 
 
 		 1167 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.93 
 
 		 1136 aa  749    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.95 
 
 		 1208 aa  787    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  45.94 
 
 		 832 aa  709    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  41.05 
 
 		 1208 aa  809    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  52.13 
 
 		 1208 aa  1164    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  45 
 
 		 1154 aa  905    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.9 
 
 		 1132 aa  717    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.9 
 
 		 1132 aa  718    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.77 
 
 		 1163 aa  800    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  36.66 
 
 		 1188 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  41.86 
 
 		 1190 aa  816    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  37.36 
 
 		 1191 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  41.98 
 
 		 1182 aa  777    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  44.39 
 
 		 1195 aa  851    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 1150 aa  2323    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  40.83 
 
 		 1169 aa  756    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  36.35 
 
 		 1188 aa  768    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  44.78 
 
 		 1156 aa  872    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  44.31 
 
 		 1178 aa  865    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  45.3 
 
 		 1154 aa  909    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  38.4 
 
 		 1182 aa  818    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  88.51 
 
 		 1149 aa  1996    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  44.74 
 
 		 1157 aa  869    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  42.14 
 
 		 1181 aa  801    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  42.04 
 
 		 1212 aa  839    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  97.48 
 
 		 1150 aa  2192    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  42.49 
 
 		 1171 aa  816    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.81 
 
 		 1132 aa  725    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  44.5 
 
 		 1171 aa  842    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  41.89 
 
 		 1223 aa  847    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  41.97 
 
 		 1192 aa  838    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  38.33 
 
 		 1156 aa  764    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  40.55 
 
 		 1136 aa  750    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  35.86 
 
 		 1266 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  39.12 
 
 		 1197 aa  795    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  40.39 
 
 		 1224 aa  813    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  40.77 
 
 		 1191 aa  850    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.9 
 
 		 1132 aa  726    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  43.81 
 
 		 1176 aa  824    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  42.5 
 
 		 1184 aa  846    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  52.16 
 
 		 1254 aa  1170    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  41.2 
 
 		 1216 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  36.54 
 
 		 1188 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.24 
 
 		 1132 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  42.29 
 
 		 1199 aa  813    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  44.51 
 
 		 1158 aa  885    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.58 
 
 		 1132 aa  738    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  52.84 
 
 		 1196 aa  1176    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  53.03 
 
 		 1189 aa  1147    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  44.15 
 
 		 1193 aa  810    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  36.52 
 
 		 1236 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  35.73 
 
 		 1250 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  36.43 
 
 		 1247 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  34.46 
 
 		 1232 aa  609  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  34.64 
 
 		 1209 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  35.47 
 
 		 1244 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  35.79 
 
 		 1251 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  34.38 
 
 		 1227 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1230 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  34.41 
 
 		 1231 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  34.2 
 
 		 1274 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.14 
 
 		 1226 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  34.62 
 
 		 1230 aa  606  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  35.63 
 
 		 1246 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  34.66 
 
 		 1227 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  34.01 
 
 		 1262 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  34.08 
 
 		 1228 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  34.69 
 
 		 1227 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1227 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  35.66 
 
 		 1271 aa  595  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  35 
 
 		 1257 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  34.22 
 
 		 1228 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1227 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1227 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1227 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  34.81 
 
 		 1257 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1227 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  34.08 
 
 		 1227 aa  595  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>