181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0083 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  100 
 
 
136 aa  249  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  96.23 
 
 
138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  95.28 
 
 
138 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  37.61 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  37.61 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  38.53 
 
 
121 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  44.14 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  43.52 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  43.52 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  40.52 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  47.22 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  46.15 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  45.37 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  44.34 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  42.86 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  48.76 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  48.86 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  46.34 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  48.91 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  43.16 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  47.75 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  46.53 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  35.46 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  48.24 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  48.24 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  47.06 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  47.06 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  47.06 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  43.27 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  48.51 
 
 
156 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  35.04 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  48.51 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  32.17 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  47.52 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  36.11 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  47.52 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  47.52 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  47.52 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  46.53 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  46.53 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  41.41 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  47.3 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.63 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.63 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  31.09 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  39.25 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  27.27 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  32.32 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  37 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  38.1 
 
 
248 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  32.35 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  36.61 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  35.43 
 
 
171 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  31.31 
 
 
116 aa  60.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  33.65 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  35.43 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  33.65 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  35.43 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  33.65 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  32 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  35.43 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  36 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  33.05 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  34 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  33.68 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  43.82 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  29.73 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  33 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  29.73 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  33.33 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  29.73 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  34.65 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  33.33 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  33 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  33 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  33.33 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  34.65 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  58.18 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>