22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0067 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  91.49 
 
 
201 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  90.78 
 
 
201 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  51.49 
 
 
202 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  35.16 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  36.17 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  34.31 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  36.17 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  34.21 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  38.64 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  35.71 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  38.64 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  32.38 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  25.55 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  27.44 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3193  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1619  hypothetical protein  35.21 
 
 
196 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>