212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0055 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  97.27 
 
 		 330 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  100 
 
 		 330 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  97.58 
 
 		 330 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  86.36 
 
 		 330 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.51 
 
 		 1017 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  31.82 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  33.01 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  32.41 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  32.92 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  28.65 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  37.18 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  34.63 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  33.54 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  0.0000489273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  34.45 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  34.3 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  32.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  34.52 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  36.05 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  36.45 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  34.42 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  35.9 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  33.97 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  35.71 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  34.6 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  31.13 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  35.39 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  34.7 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  34.7 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  34.63 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  36.51 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  35.6 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  34.82 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  35.46 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  26.71 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  34.5 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  36.27 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  26.09 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  35.92 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  33.76 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  35.35 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  25.78 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  33.55 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  33.02 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  35.41 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  31.79 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  33.12 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  35.81 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  32.25 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  25.99 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  33.97 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  33.66 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  33.65 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  33.66 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  33.23 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  32.48 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  34.82 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  34.31 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  32.5 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  33.44 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  32.09 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  31.85 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  28.95 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  34.09 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  33.77 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  33.14 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  33.66 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  32.7 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  32.78 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  28.89 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  33.02 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  30.28 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  27.97 
 
 		 337 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  31.56 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  30.15 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  32.42 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  30.77 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  30.5 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  28.57 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5670  hypothetical protein  29.38 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  25.16 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0104249 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1169  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.561924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 422 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 454 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  29.53 
 
 		 813 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.25 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  27.9 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>