More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0034 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  97.97 
 
 
543 aa  968    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  100 
 
 
543 aa  1050    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  74.39 
 
 
537 aa  779    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  97.61 
 
 
543 aa  974    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  55.03 
 
 
528 aa  535  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.07 
 
 
533 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.37 
 
 
533 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.75 
 
 
533 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  52.18 
 
 
530 aa  525  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.28 
 
 
533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  50.97 
 
 
553 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  51.36 
 
 
543 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  49.7 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  49.61 
 
 
527 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  50.67 
 
 
531 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  45.58 
 
 
526 aa  389  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  33.33 
 
 
531 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.23 
 
 
504 aa  170  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.13 
 
 
504 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  54.25 
 
 
377 aa  166  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.73 
 
 
492 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  29.11 
 
 
497 aa  153  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.89 
 
 
518 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.9 
 
 
492 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.74 
 
 
492 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.51 
 
 
492 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.36 
 
 
492 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.51 
 
 
492 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.51 
 
 
492 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  26.67 
 
 
508 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.21 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.21 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.3 
 
 
493 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.21 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.3 
 
 
493 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.21 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.21 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.68 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.51 
 
 
492 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  27.19 
 
 
489 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 
492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.73 
 
 
489 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.68 
 
 
492 aa  143  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.99 
 
 
488 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  26.65 
 
 
489 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.77 
 
 
482 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24 
 
 
493 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  26.95 
 
 
541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.47 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.79 
 
 
506 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  29.69 
 
 
496 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  24.25 
 
 
491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.02 
 
 
495 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  24.09 
 
 
492 aa  136  8e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.79 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.19 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  26.29 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.97 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  27.51 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  29.12 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  27.51 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.29 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  27.51 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  26.99 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  27.51 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  29.12 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  25.17 
 
 
488 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24.03 
 
 
489 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  26.03 
 
 
494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  27.21 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.19 
 
 
499 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  26.28 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  27.21 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  27.21 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.48 
 
 
484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  27.21 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.27 
 
 
483 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  25.97 
 
 
494 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.66 
 
 
486 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  27.29 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  26.67 
 
 
499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.99 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.24 
 
 
489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  26.81 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.85 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.24 
 
 
489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.85 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>