191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0027 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
329 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.01 
 
 
329 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.19 
 
 
329 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.14 
 
 
321 aa  335  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 
316 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.87 
 
 
318 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 
312 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.17 
 
 
317 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 
306 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
309 aa  175  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
300 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
324 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
304 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 
315 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
325 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
313 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
307 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.17 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
301 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
314 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
304 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.67 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
352 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
340 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 
338 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
309 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
326 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
344 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
327 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  32.67 
 
 
332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  32.67 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  32.67 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.67 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.67 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  32.67 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
326 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  33.01 
 
 
318 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
316 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.56 
 
 
333 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
311 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  23.26 
 
 
305 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
311 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
326 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
311 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
308 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
312 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  28.47 
 
 
370 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
326 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.94 
 
 
310 aa  85.9  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  31.61 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.54 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.64 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  29.49 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
308 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
299 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  26.05 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
307 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>