220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0023 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  89.12 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  88.37 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.79 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  36.94 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.45 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  37.92 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  34.8 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  33.09 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  36.06 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.4 
 
 		 280 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  34.59 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  38.87 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  31.49 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  35.66 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  37.76 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  39.18 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  35.1 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.34 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 259 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  35.74 
 
 		 260 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  33.56 
 
 		 287 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  39.38 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  32.13 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  35.89 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.31 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  34.94 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  37.07 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  37.96 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  32.94 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  35.16 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  35.13 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.79 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  34.31 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.18 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  35.89 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  36.1 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  39.45 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  36.18 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  38.39 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  32.57 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  36.69 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  36.94 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>