235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0057 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 97 bp  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000328562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0003  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 96 bp  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  hitchhiker  0.00000112362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  95 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  95 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0002  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000899468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  60  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0212707  normal  0.0426305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4560  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0913747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0039  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0742703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  84.69 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0033  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.172474  normal  0.681526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0043  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710531 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0049  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0035  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.802654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0014  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000019033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0100  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0041  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.589584  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0024  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0047  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327618  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0048  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_002950  PGt17  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0062  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1359  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.89612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0007  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.715121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0012  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0470905  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1302  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1044  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t084  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t090  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t24  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA56  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00168094  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R71  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000974283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0038  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000174054  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0044  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000325542  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>