More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0023 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0033  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0039  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0019  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0043  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  91.55 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  91.55 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  94.83 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  89.61 
 
 
80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0051  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094292  normal  0.53316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0010  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.448229  hitchhiker  0.009241 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0385  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.900506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3083  tRNA-Ile  89.61 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.22 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.31 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>