26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0003 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0035  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0049  tRNA-Val  94.59 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.193583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0029  tRNA-Lys  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0031  tRNA-Lys  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00676578  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.227787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0066  tRNA-Val  82.67 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161361  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0024  tRNA-Val  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0030  tRNA-Met  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410556  normal  0.490456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0029  tRNA-Val  89.47 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0021  tRNA-Val  89.47 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.357184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0021  tRNA-Val  89.47 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>