More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2135 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  283  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  47.02 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  43.05 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
149 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.86 
 
 
149 aa  123  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  44.06 
 
 
148 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  43.33 
 
 
148 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  44.06 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.15 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
146 aa  114  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  45.33 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  47.48 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  44.9 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  44.3 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
148 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  41.33 
 
 
151 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
148 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  42.95 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
148 aa  110  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
165 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  40.54 
 
 
148 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  42.66 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
151 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 
171 aa  105  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
160 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
151 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.67 
 
 
149 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  45.58 
 
 
150 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 
151 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
151 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  45.95 
 
 
147 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  40.13 
 
 
148 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
149 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
150 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
151 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  36.73 
 
 
157 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  41.33 
 
 
151 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
147 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
149 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
149 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 
149 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  42.34 
 
 
165 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
150 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
189 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 
149 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.99 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  36.3 
 
 
167 aa  98.2  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  39.19 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>