More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1981 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  55.91 
 
 		 221 aa  254  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  60.75 
 
 		 215 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  53.46 
 
 		 218 aa  241  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 214 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  55.35 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  51.16 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  53.92 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  61.29 
 
 		 187 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50.68 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  49.03 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  50.92 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.33 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  51.17 
 
 		 214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  50.47 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  52.85 
 
 		 207 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  49.77 
 
 		 211 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  56.92 
 
 		 199 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.66 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.66 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  49.3 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  53.65 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  49.31 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  52.53 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  51.55 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  48.36 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  47.89 
 
 		 205 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  45.21 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.83 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  51.01 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  48.36 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.33 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  54.12 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.52 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  51.3 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.77 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  52.33 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 220 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  44.6 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.45 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.56 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  48.45 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  48.45 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  47.34 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.4 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  44.64 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.02 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  43.26 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>