More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1966 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  100 
 
 
524 aa  1018    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
523 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  57.82 
 
 
526 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  48.31 
 
 
521 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  46.46 
 
 
533 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  36.48 
 
 
534 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  38.01 
 
 
529 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  37.58 
 
 
521 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  36.65 
 
 
521 aa  289  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 
511 aa  287  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  35.57 
 
 
511 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 
524 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 
524 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 
524 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 
524 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 
524 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  38.25 
 
 
521 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  35.7 
 
 
511 aa  276  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  35.5 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 
528 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  38.04 
 
 
515 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  38.77 
 
 
512 aa  269  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  35.95 
 
 
521 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 
508 aa  269  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  37.76 
 
 
511 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  37.76 
 
 
511 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 
511 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
511 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  37.32 
 
 
511 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  33.48 
 
 
514 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  36.31 
 
 
512 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  36.31 
 
 
512 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  36.26 
 
 
512 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  37.83 
 
 
515 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  44.7 
 
 
556 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  35.62 
 
 
511 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 
530 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  31.01 
 
 
523 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 
512 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  36.43 
 
 
512 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 
511 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 
542 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.52 
 
 
512 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  35.47 
 
 
522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  37.04 
 
 
534 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  38.77 
 
 
512 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  35.07 
 
 
522 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  35.91 
 
 
528 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  35.27 
 
 
518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  31.67 
 
 
512 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  35.24 
 
 
522 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  35.87 
 
 
495 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  36.93 
 
 
521 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 
522 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  36.57 
 
 
516 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  33.6 
 
 
526 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.19 
 
 
516 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 
513 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  36.68 
 
 
517 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  36.68 
 
 
517 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  37.64 
 
 
512 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  35.57 
 
 
512 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  36.99 
 
 
521 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  35.86 
 
 
521 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  35.05 
 
 
517 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  35.1 
 
 
511 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  32.89 
 
 
523 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  37.42 
 
 
513 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 
516 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  36.46 
 
 
520 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 
522 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  34.41 
 
 
530 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  32.67 
 
 
523 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  37.91 
 
 
511 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  34.41 
 
 
530 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  36.13 
 
 
514 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  31.33 
 
 
534 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  35.12 
 
 
521 aa  226  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 
573 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.59 
 
 
519 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  35.12 
 
 
532 aa  226  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  37.3 
 
 
522 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  32.3 
 
 
519 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  31.59 
 
 
519 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  36.96 
 
 
516 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  35.75 
 
 
511 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  34.53 
 
 
498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  35.78 
 
 
521 aa  223  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 
519 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  34.54 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  32.88 
 
 
531 aa  222  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  33.86 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>