More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1940 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
111 aa  214  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  51.76 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  51.76 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  53.85 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  49.43 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 
114 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
103 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
134 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.57 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.57 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  44.19 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  43.02 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  43.68 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  50 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  38.46 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  48.61 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  41.76 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>