More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1930 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  69.94 
 
 		 175 aa  263  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  69.14 
 
 		 178 aa  257  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  66.86 
 
 		 175 aa  246  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  66.86 
 
 		 175 aa  240  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  66.47 
 
 		 175 aa  234  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  57.8 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  58.96 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  63.37 
 
 		 203 aa  227  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  59.66 
 
 		 181 aa  225  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  63.58 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  54.91 
 
 		 194 aa  223  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  54.34 
 
 		 194 aa  221  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  58.43 
 
 		 182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  58.43 
 
 		 182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  61.49 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  57.87 
 
 		 182 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 188 aa  217  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  59.54 
 
 		 176 aa  217  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  62.5 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  58.48 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  54.39 
 
 		 201 aa  206  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  52.6 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  52.02 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  53.41 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  54.02 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  53.04 
 
 		 273 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  54.8 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  54.8 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  52.25 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  51.69 
 
 		 266 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  53.01 
 
 		 306 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  50.88 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  51.4 
 
 		 250 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  53.18 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.45 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  50.86 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  52.15 
 
 		 265 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  52.87 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  52.27 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  51.96 
 
 		 238 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  51.72 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  53.18 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 243 aa  189  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  53.98 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  49.19 
 
 		 280 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  51.65 
 
 		 273 aa  187  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  53.18 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  48.63 
 
 		 266 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  52.02 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  52.02 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  53.18 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  49.2 
 
 		 272 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  53.18 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  45.26 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  51.43 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  51.43 
 
 		 193 aa  184  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 196 aa  184  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  49.13 
 
 		 196 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>