More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1928 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  78.26 
 
 		 231 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  74.34 
 
 		 231 aa  362  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  73.91 
 
 		 232 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  70.43 
 
 		 233 aa  348  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  74.12 
 
 		 233 aa  348  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  73.8 
 
 		 229 aa  342  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  71.37 
 
 		 230 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  72.37 
 
 		 230 aa  332  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  68.75 
 
 		 233 aa  330  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  69.16 
 
 		 234 aa  322  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  68.44 
 
 		 234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  68.86 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  72.69 
 
 		 229 aa  318  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  72.69 
 
 		 229 aa  318  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  68.44 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  68.78 
 
 		 233 aa  316  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 		 233 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  64.19 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  66.37 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 231 aa  310  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  66.37 
 
 		 233 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 241 aa  309  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  70.31 
 
 		 233 aa  307  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  65.49 
 
 		 230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  69.87 
 
 		 233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  305  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  62.45 
 
 		 230 aa  304  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  62.45 
 
 		 230 aa  304  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  64.04 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  61.14 
 
 		 230 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 230 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  62.88 
 
 		 229 aa  301  7.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  63.39 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  61.74 
 
 		 232 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  61.9 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 230 aa  296  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  63.39 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  62.17 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  62.95 
 
 		 238 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  61.9 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  63.2 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  62.56 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 		 231 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 234 aa  291  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  62.5 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 229 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 234 aa  291  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  62.56 
 
 		 235 aa  290  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  63.11 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  62.95 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  64.09 
 
 		 231 aa  288  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  63.3 
 
 		 234 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 232 aa  286  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  56.9 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  63.16 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  59.23 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  58.19 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  61.23 
 
 		 236 aa  285  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 234 aa  282  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  59.74 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  62.45 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  62.07 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  60.55 
 
 		 234 aa  281  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 229 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  60.54 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  59.48 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 242 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  61.64 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 239 aa  281  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  60.79 
 
 		 232 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  64.6 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  59.65 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  57.94 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>