More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1927 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  100 
 
 
176 aa  343  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  50 
 
 
175 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 
181 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  45.66 
 
 
177 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  46.58 
 
 
179 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  45.14 
 
 
176 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  44.17 
 
 
175 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  48.82 
 
 
174 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  47.59 
 
 
178 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  46.75 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  45.88 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  44.12 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  45.09 
 
 
173 aa  144  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  47.09 
 
 
183 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  45.29 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  45.61 
 
 
174 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 
174 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  44.05 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
173 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
173 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 
174 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  43.11 
 
 
173 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  47.37 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40.7 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 
174 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 
187 aa  125  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  39.75 
 
 
186 aa  124  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 
166 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 
166 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  43.02 
 
 
176 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 
166 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  40.49 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  42.2 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  42.94 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
172 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  40.68 
 
 
179 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  40.68 
 
 
179 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  38.46 
 
 
256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 
178 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  38.15 
 
 
173 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  38.46 
 
 
203 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.28 
 
 
174 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 
178 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 
172 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  39.2 
 
 
182 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  40 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.15 
 
 
172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  42.77 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  38.07 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  36.97 
 
 
200 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 
166 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 
166 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  42.86 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  40.11 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  36.42 
 
 
174 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 
172 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 
175 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  36.99 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 
166 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
173 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  41.14 
 
 
228 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.32 
 
 
166 aa  107  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  38.73 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  42.77 
 
 
173 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  33.13 
 
 
174 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  38.46 
 
 
176 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 
175 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  43.02 
 
 
175 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 
172 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 
175 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 
178 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 
175 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 
175 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 
172 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  34.32 
 
 
173 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
176 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 
172 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 
171 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 
181 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>