More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1925 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
855 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 
885 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
855 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 
858 aa  714    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  49.72 
 
 
871 aa  778    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  49.72 
 
 
897 aa  839    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  45.47 
 
 
903 aa  742    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
888 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 
873 aa  725    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.3 
 
 
854 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
871 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  48.4 
 
 
932 aa  787    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
892 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
855 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 
858 aa  648    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  49.31 
 
 
873 aa  828    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  46.22 
 
 
837 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 
855 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
892 aa  710    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 
890 aa  709    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 
894 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  45.92 
 
 
881 aa  696    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  45.15 
 
 
903 aa  669    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  50.52 
 
 
850 aa  768    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
859 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
881 aa  731    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  47.83 
 
 
872 aa  740    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.98 
 
 
895 aa  724    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.44 
 
 
869 aa  790    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
900 aa  690    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  59.52 
 
 
882 aa  937    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  45.94 
 
 
872 aa  708    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 
854 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 
872 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.34 
 
 
863 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 
860 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  47.11 
 
 
860 aa  772    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  48.4 
 
 
870 aa  781    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  45.86 
 
 
858 aa  704    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 
854 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 
851 aa  637    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 
872 aa  777    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 
904 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 
868 aa  667    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
892 aa  710    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 
896 aa  665    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  45.54 
 
 
882 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
928 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 
872 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  52.44 
 
 
863 aa  785    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  47.57 
 
 
867 aa  787    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  47.96 
 
 
882 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  49.66 
 
 
870 aa  846    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 
892 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  46.96 
 
 
870 aa  744    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  50.23 
 
 
868 aa  847    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.02 
 
 
882 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
855 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 
855 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
855 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  47.74 
 
 
882 aa  677    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 
855 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
892 aa  710    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  47.79 
 
 
896 aa  814    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  46.6 
 
 
823 aa  677    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
887 aa  738    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
864 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 
910 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  47.85 
 
 
882 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
863 aa  652    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 
888 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 
882 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
865 aa  1748    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 
854 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 
872 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 
856 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
875 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  48.97 
 
 
872 aa  753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 
892 aa  712    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  46.53 
 
 
910 aa  742    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  46.4 
 
 
910 aa  741    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 
890 aa  711    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.2 
 
 
901 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  43.61 
 
 
892 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  48 
 
 
863 aa  825    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 
865 aa  642    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  46.52 
 
 
853 aa  754    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  48.56 
 
 
859 aa  808    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  44.94 
 
 
880 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
874 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
855 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 
840 aa  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 
857 aa  699    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
854 aa  675    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
852 aa  670    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  48.17 
 
 
869 aa  751    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  46.14 
 
 
857 aa  732    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.07 
 
 
889 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 
868 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 
890 aa  712    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>