More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1889 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  100 
 
 
434 aa  844    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  70.11 
 
 
451 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  68.51 
 
 
457 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  70.24 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  63.22 
 
 
462 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  64.67 
 
 
461 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  66.18 
 
 
449 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  62.96 
 
 
464 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  59.36 
 
 
410 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  59.36 
 
 
411 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  59.61 
 
 
410 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  59.85 
 
 
410 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  59.61 
 
 
410 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  59.61 
 
 
410 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  59.85 
 
 
410 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  59.36 
 
 
410 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  59.36 
 
 
410 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  61.94 
 
 
405 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  59.01 
 
 
406 aa  485  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  57.8 
 
 
428 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  63.18 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  59.81 
 
 
470 aa  461  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  62.41 
 
 
411 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  54.69 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  62.32 
 
 
402 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  61.48 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  61.23 
 
 
408 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  60.99 
 
 
408 aa  441  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  60.93 
 
 
402 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  56.03 
 
 
444 aa  421  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  53.44 
 
 
431 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  54.26 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  54.12 
 
 
488 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  55.87 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  55.31 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  55.72 
 
 
438 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  54.81 
 
 
402 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  55.72 
 
 
438 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  54.07 
 
 
402 aa  414  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  53.6 
 
 
489 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  51.54 
 
 
433 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  54.55 
 
 
470 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  56.51 
 
 
401 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  53.88 
 
 
515 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  53.41 
 
 
515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  59.21 
 
 
401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  54.15 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  57.44 
 
 
423 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  54.57 
 
 
431 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  52.1 
 
 
397 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  53.02 
 
 
496 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  53.04 
 
 
485 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  56.27 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  52.4 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  52.4 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  52.4 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  55 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  52.4 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  52.4 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.92 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  52.16 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  52.4 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  52.4 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  52.51 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  51.68 
 
 
500 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  51.68 
 
 
500 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  51.68 
 
 
500 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  51.68 
 
 
500 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  52.79 
 
 
507 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  54.34 
 
 
397 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  55.37 
 
 
456 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.6 
 
 
501 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  51.61 
 
 
400 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  53.9 
 
 
454 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  52.48 
 
 
399 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  52.74 
 
 
459 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  55.15 
 
 
456 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50.73 
 
 
427 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  55.15 
 
 
456 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  52.86 
 
 
433 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  51.23 
 
 
436 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  50.48 
 
 
499 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  51.72 
 
 
431 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50.35 
 
 
436 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  52.93 
 
 
455 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.92 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.98 
 
 
494 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  49.27 
 
 
432 aa  382  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.92 
 
 
497 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  50.24 
 
 
502 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.62 
 
 
445 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  51.49 
 
 
398 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  52.29 
 
 
439 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.46 
 
 
445 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  55.06 
 
 
456 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.02 
 
 
429 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  49.05 
 
 
467 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  55.15 
 
 
397 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  50.6 
 
 
432 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  49.39 
 
 
434 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>