133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1808 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  93.15 
 
 		 219 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  79.63 
 
 		 216 aa  358  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  51.92 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  51.92 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  52.4 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  51.69 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  51.69 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  50.48 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  50.96 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  48.1 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  48.1 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  46.19 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  44.17 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  46.11 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  43.6 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  44.08 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  42.65 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 197 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  40.19 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  38.97 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  38.97 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  41 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  41 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 		 194 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  39.8 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  35.68 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  36.59 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  39.8 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  39 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  39 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  36.32 
 
 		 222 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  37 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  40 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  35.07 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.32 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  39 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  35.85 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  36.87 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  36.87 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.3 
 
 		 197 aa  121  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  36.18 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  33.67 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.17 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  33.99 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.68 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.68 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  36.32 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.87 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  31.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  36.27 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  38.18 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  28.37 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  36.65 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  33.33 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  34.97 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  35.52 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  34.57 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  34.43 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  32.65 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  35.1 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  52.11 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  33.76 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  30.97 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  33.15 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  32.64 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  22.82 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  22.33 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  32.48 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  50 
 
 		 75 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  34.07 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  47.27 
 
 		 67 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  37.08 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  46.94 
 
 		 80 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  40.38 
 
 		 87 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  47.27 
 
 		 68 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  34.25 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 74 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  48.21 
 
 		 71 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 		 64 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 73 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  42.86 
 
 		 137 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  48 
 
 		 65 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 88 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 		 72 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  46.55 
 
 		 68 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  35 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>