40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1765 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  59.47 
 
 
190 aa  236  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  39.18 
 
 
202 aa  146  1e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.1 
 
 
198 aa  140  1e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.02 
 
 
198 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.3 
 
 
197 aa  129  2e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.14 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  29.74 
 
 
195 aa  82.8  3e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.69 
 
 
197 aa  78.6  5e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  26.6 
 
 
198 aa  77.4  1e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.26 
 
 
193 aa  73.9  1e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  30 
 
 
190 aa  73.9  1e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  24.19 
 
 
197 aa  70.1  2e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.27 
 
 
204 aa  67  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.26 
 
 
544 aa  65.9  4e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.34 
 
 
205 aa  65.9  4e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  27.96 
 
 
200 aa  64.3  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  28.42 
 
 
212 aa  63.9  1e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.8 
 
 
210 aa  60.8  1e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  25.81 
 
 
196 aa  59.3  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  25.81 
 
 
196 aa  59.7  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  25.14 
 
 
190 aa  56.2  3e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  26.6 
 
 
196 aa  55.8  4e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  26.34 
 
 
206 aa  55.1  6e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.57 
 
 
211 aa  54.7  7e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  23.12 
 
 
194 aa  54.7  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  31.15 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.87 
 
 
545 aa  53.5  2e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 
196 aa  52.4  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  22.99 
 
 
206 aa  52  5e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  30.33 
 
 
218 aa  50.4  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  25.95 
 
 
204 aa  48.5  5e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  25.81 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.74 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  3.42837e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  25.79 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.76 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 
1019 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.86 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.32 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1502  hypothetical protein  26.92 
 
 
102 aa  41.2  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.314393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>