59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1703 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 263 aa  517  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  43.7 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  45.38 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  39.78 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  39.11 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  35.02 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  35.53 
 
 		 235 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  33.18 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  33.18 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  33.18 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  35.4 
 
 		 233 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  52.1 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  31.25 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  33.66 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  33.66 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  33.66 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  33.66 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  33.66 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  33.66 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  33.66 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  28.14 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  28.19 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  28.23 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  28.23 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  28.29 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  29.39 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  24.74 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  26.7 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  26.15 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  37.18 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  34.12 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  34.62 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  31.87 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  22.7 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  25.76 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  32.98 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  30.84 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  32.98 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  29.89 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.59 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.59 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  31.91 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  31.91 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  31.91 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  31.91 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  31.91 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  30.85 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  34.72 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  31.37 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_002936  DET0539  DnaD and phage-associated domain-containing protein  36.51 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245634  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_480  primosome component  36.51 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  30.86 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  30.86 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  29.03 
 
 		 158 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3310  DnaD domain protein  35.94 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0537  primosome, DnaD subunit  27.43 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2616  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 		 321 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00360239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>