More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1696 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  57.34 
 
 
765 aa  829    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  50.63 
 
 
727 aa  689    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  48.81 
 
 
828 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
761 aa  1550    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  45.73 
 
 
905 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  50.16 
 
 
727 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  53.2 
 
 
709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  40.81 
 
 
795 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  40.62 
 
 
880 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 
941 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  40.06 
 
 
806 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  41.59 
 
 
706 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 
843 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 
829 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.59 
 
 
814 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  39.12 
 
 
705 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 
704 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  39 
 
 
679 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.86 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.82 
 
 
643 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.82 
 
 
643 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  37.95 
 
 
912 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  38.51 
 
 
680 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  38.28 
 
 
680 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  38.51 
 
 
667 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  38.12 
 
 
680 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  38.35 
 
 
673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  37.96 
 
 
680 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  40.78 
 
 
640 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.91 
 
 
648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  39.72 
 
 
643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  38.28 
 
 
680 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  38.35 
 
 
673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  38.28 
 
 
680 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  42.35 
 
 
761 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  39.76 
 
 
746 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  38.75 
 
 
705 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  39.83 
 
 
746 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.44 
 
 
618 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  38.87 
 
 
705 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  38.71 
 
 
705 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  38.55 
 
 
705 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 
835 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 
834 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  38.87 
 
 
705 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  38.55 
 
 
705 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  39.1 
 
 
837 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 
846 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 
834 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  38.1 
 
 
705 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 
640 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 
820 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  38.65 
 
 
705 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  43.24 
 
 
712 aa  398  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  40.65 
 
 
626 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  35.66 
 
 
861 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  40.03 
 
 
853 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 
839 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  39.56 
 
 
830 aa  396  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  38.01 
 
 
701 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  37.67 
 
 
679 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.25 
 
 
744 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.23 
 
 
824 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  39.31 
 
 
837 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.51 
 
 
693 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  38.58 
 
 
832 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  37.25 
 
 
901 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  43.04 
 
 
654 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.87 
 
 
776 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.97 
 
 
728 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.1 
 
 
727 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 
728 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 
662 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  40.8 
 
 
691 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 
836 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  41.9 
 
 
714 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  41.65 
 
 
727 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.54 
 
 
668 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  37.9 
 
 
655 aa  378  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  38.28 
 
 
755 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.97 
 
 
656 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 
801 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 
648 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  36.08 
 
 
642 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  42.05 
 
 
714 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  37.76 
 
 
667 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  40.95 
 
 
860 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  35.34 
 
 
642 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  36.83 
 
 
794 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.01 
 
 
646 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.16 
 
 
734 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  38.7 
 
 
625 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  38.99 
 
 
757 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  39.76 
 
 
741 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.57 
 
 
685 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.89 
 
 
811 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  38.36 
 
 
721 aa  366  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.65 
 
 
709 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
654 aa  363  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  40 
 
 
658 aa  363  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>