More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1667 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  61.9 
 
 
107 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  57.14 
 
 
105 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  57.14 
 
 
105 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  57.69 
 
 
112 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  57.69 
 
 
112 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  60 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  53.92 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  57.28 
 
 
115 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  56.44 
 
 
124 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.38 
 
 
125 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.33 
 
 
110 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  55.67 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.37 
 
 
107 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  53.47 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  55.45 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  55.24 
 
 
106 aa  128  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.47 
 
 
106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  52.58 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  48.11 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  52.48 
 
 
108 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  53.06 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  52.58 
 
 
107 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  53 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  52.43 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  54.81 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  48.04 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  47.17 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  56.25 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  51.49 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  47.17 
 
 
110 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  51.49 
 
 
108 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  54.55 
 
 
106 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  47.62 
 
 
109 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  53.54 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  48.08 
 
 
109 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  48.08 
 
 
109 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  48.57 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  49.52 
 
 
107 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  46.23 
 
 
110 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  47.12 
 
 
146 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  52.48 
 
 
109 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>