More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1661 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  51.72 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  52.54 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  50.42 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  49.56 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  53.51 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  54.55 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  44.72 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  49.09 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  40.17 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  46.61 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 132 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  44.17 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  45.3 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  42.59 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  44.74 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  41.75 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  42.37 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  42.59 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0072  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.884445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  44.04 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  44.54 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  41.12 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  40.34 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  40.19 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  44.04 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  48.84 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  37.82 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>