More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1632 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.97 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  52.98 
 
 		 162 aa  174  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  52.26 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.33 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  53.64 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.33 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  47.17 
 
 		 161 aa  160  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.68 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 		 182 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.5 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  52.63 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.05 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.33 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 173 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.64 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.82 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  52.32 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.1 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  41.88 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.66 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  41.45 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.29 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.51 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.48 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.86 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  42.86 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 181 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.65 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  39.1 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 181 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0992  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.51 
 
 		 206 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0391793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.82 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 182 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.52 
 
 		 192 aa  120  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 176 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 		 192 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.16 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 189 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>