More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1620 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  48.36 
 
 
282 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  43.8 
 
 
279 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  51.57 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
321 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  39.35 
 
 
319 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
1015 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
224 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  36.44 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  33.47 
 
 
306 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  33.47 
 
 
306 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 
234 aa  139  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
645 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 
510 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  33.92 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  35.91 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  38.99 
 
 
251 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
627 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  37.34 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  37.34 
 
 
233 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
1001 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  37.99 
 
 
238 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
239 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 
238 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
615 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
615 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.22 
 
 
590 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  35.45 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 
274 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
253 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 
276 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.38 
 
 
373 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.72 
 
 
319 aa  116  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  32.29 
 
 
284 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
336 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  35.17 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
659 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
249 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
233 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
275 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
659 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
660 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  31.76 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  31.6 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 
426 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  30.25 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  30.38 
 
 
273 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 
285 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  30.38 
 
 
273 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  34.25 
 
 
277 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 
401 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 
273 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
598 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  30.17 
 
 
363 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.25 
 
 
256 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  31.63 
 
 
320 aa  106  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 
272 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
249 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  31.62 
 
 
276 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 
273 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 
348 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  31.1 
 
 
417 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 
437 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
264 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
348 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 
239 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
348 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  31.1 
 
 
417 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 
313 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
348 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  30.25 
 
 
318 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
244 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 
370 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  33.92 
 
 
366 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
415 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
244 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
244 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 
348 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
348 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
348 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
689 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 
322 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
348 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
348 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
276 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>