More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1615 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 
251 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  60.73 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  57.89 
 
 
250 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  59.61 
 
 
257 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  54.58 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 
249 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 
248 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 
253 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  56.5 
 
 
249 aa  276  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 
250 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 
249 aa  274  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
251 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  56.05 
 
 
250 aa  271  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 
251 aa  271  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  55.6 
 
 
251 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
248 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
248 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
251 aa  268  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
251 aa  268  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
251 aa  268  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
251 aa  268  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 
251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
251 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  53.25 
 
 
251 aa  267  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  53.73 
 
 
257 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
251 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
251 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
251 aa  265  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 
253 aa  264  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 
250 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  54.33 
 
 
250 aa  263  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.5 
 
 
655 aa  263  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  52.57 
 
 
256 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.85 
 
 
650 aa  262  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  55.47 
 
 
254 aa  262  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 
251 aa  261  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  53.15 
 
 
252 aa  261  8.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 
253 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 
251 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 
253 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 
253 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.44 
 
 
646 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 
252 aa  258  8e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 
254 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  54.72 
 
 
253 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 
251 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 
250 aa  256  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  54.43 
 
 
243 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  54.58 
 
 
243 aa  255  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  53.17 
 
 
253 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  51.36 
 
 
265 aa  252  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  51.38 
 
 
250 aa  251  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  51 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 
250 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 
249 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
252 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
253 aa  248  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
252 aa  248  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.66 
 
 
654 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
261 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 
251 aa  247  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  53.2 
 
 
246 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  51.57 
 
 
251 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 
260 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
256 aa  245  6e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  50 
 
 
261 aa  244  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 
262 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 
257 aa  244  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  52.19 
 
 
260 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  51 
 
 
254 aa  242  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  50 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  50 
 
 
287 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
253 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 
298 aa  241  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
255 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
248 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 
248 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
252 aa  240  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 
261 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  50.98 
 
 
256 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
252 aa  239  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  49.79 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 
254 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48.61 
 
 
263 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
241 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 
253 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 
251 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  50 
 
 
261 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  50 
 
 
261 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>