More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1526 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  75.06 
 
 
405 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  83.92 
 
 
400 aa  699    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  82 
 
 
400 aa  696    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  75.06 
 
 
405 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  82.16 
 
 
400 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  82.66 
 
 
400 aa  694    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  80.25 
 
 
400 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  99.75 
 
 
400 aa  808    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78.95 
 
 
395 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  78.5 
 
 
396 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  809    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  78.5 
 
 
396 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  79.25 
 
 
400 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  83.25 
 
 
400 aa  697    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  82.66 
 
 
400 aa  694    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  81.75 
 
 
400 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  82 
 
 
400 aa  695    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  83.67 
 
 
399 aa  697    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  82.16 
 
 
400 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  79.25 
 
 
400 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  78 
 
 
400 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  81.75 
 
 
400 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  78.5 
 
 
396 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  81.16 
 
 
400 aa  672    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  81.16 
 
 
400 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  78.5 
 
 
396 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  77 
 
 
397 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  77 
 
 
397 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  76.56 
 
 
400 aa  627  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  78.75 
 
 
397 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  78.75 
 
 
397 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  76.56 
 
 
400 aa  627  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  76 
 
 
399 aa  624  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.81 
 
 
396 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.81 
 
 
396 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  76 
 
 
399 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  75.44 
 
 
399 aa  624  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  76.25 
 
 
400 aa  621  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  75.31 
 
 
400 aa  620  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.06 
 
 
396 aa  618  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.06 
 
 
396 aa  618  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.5 
 
 
396 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.5 
 
 
396 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  78.08 
 
 
405 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  78.08 
 
 
405 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.81 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.81 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  74.44 
 
 
399 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  74.69 
 
 
399 aa  616  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  74.44 
 
 
399 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  75.25 
 
 
399 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  75.25 
 
 
399 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  75.81 
 
 
396 aa  615  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  75.81 
 
 
396 aa  615  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  74.44 
 
 
399 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  75.31 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  76.98 
 
 
402 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  75.31 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  77.23 
 
 
402 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  75.31 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  75.31 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.5 
 
 
396 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.5 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  76.56 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  76.56 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  74.49 
 
 
397 aa  607  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  74 
 
 
397 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  76.31 
 
 
396 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  74.5 
 
 
396 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  74.5 
 
 
396 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.75 
 
 
394 aa  610  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  72.75 
 
 
400 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.75 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  74.5 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  74.56 
 
 
396 aa  604  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  75.62 
 
 
405 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  76.06 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  77.75 
 
 
395 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  76.44 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  76.44 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  75.86 
 
 
405 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.63 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  75.81 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  74.12 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.63 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>