More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1524 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  72.68 
 
 
209 aa  310  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  71.84 
 
 
209 aa  301  4e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  70.73 
 
 
209 aa  299  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  69.71 
 
 
213 aa  298  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  70.05 
 
 
210 aa  290  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  69.08 
 
 
210 aa  284  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  66.5 
 
 
209 aa  282  2e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  63.9 
 
 
212 aa  277  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  65.53 
 
 
211 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  65.37 
 
 
211 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  66.33 
 
 
213 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
209 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  61.54 
 
 
210 aa  259  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  60.58 
 
 
210 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 
209 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 
211 aa  258  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  61.06 
 
 
210 aa  257  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  61.65 
 
 
211 aa  258  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  61.06 
 
 
210 aa  257  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
212 aa  257  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  62.02 
 
 
213 aa  254  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 
212 aa  245  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  59.62 
 
 
208 aa  245  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  60 
 
 
205 aa  243  2e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  6.60439e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  58.54 
 
 
215 aa  242  2e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  58.65 
 
 
208 aa  241  7e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  57.28 
 
 
210 aa  238  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  59.02 
 
 
207 aa  237  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  59.02 
 
 
207 aa  237  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  57.21 
 
 
222 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.03 
 
 
212 aa  233  2e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
210 aa  232  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  56.52 
 
 
216 aa  232  4e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  56.07 
 
 
220 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.23614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 
211 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  53.61 
 
 
217 aa  230  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
207 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.58376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  57.07 
 
 
228 aa  228  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  55.94 
 
 
206 aa  228  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  55.67 
 
 
218 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
211 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  54.41 
 
 
209 aa  227  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 
207 aa  227  9e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  55.17 
 
 
218 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  53.74 
 
 
220 aa  227  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  55.14 
 
 
220 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.05261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 
210 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.31463e-05  hitchhiker  3.31617e-13 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  52.2 
 
 
206 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 
218 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  55.77 
 
 
213 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
211 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 
218 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 
209 aa  221  5e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.00637e-07  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 
216 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  221  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 
208 aa  220  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 
218 aa  220  1e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 
223 aa  219  2e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 
210 aa  219  2e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.81863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
216 aa  218  4e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  51.98 
 
 
209 aa  218  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  5.62685e-12  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
223 aa  217  8e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  52.4 
 
 
215 aa  217  8e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 
213 aa  217  9e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 
219 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.63613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 
216 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 
221 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  51.67 
 
 
226 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  53.5 
 
 
211 aa  216  3e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 
218 aa  215  3e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  54.29 
 
 
217 aa  215  3e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 
209 aa  215  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
210 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 
212 aa  214  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 
209 aa  214  6e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 
209 aa  214  6e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.83333e-10  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 
209 aa  214  6e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.56273e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  51.83 
 
 
227 aa  214  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 
218 aa  213  1e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  52.88 
 
 
216 aa  213  1e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 
219 aa  213  1e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.61 
 
 
218 aa  214  1e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 
209 aa  213  1e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 
212 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  53.59 
 
 
209 aa  213  2e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 
209 aa  213  2e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 
212 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 
212 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 
210 aa  212  3e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 
209 aa  212  3e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  50 
 
 
219 aa  212  3e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 
217 aa  212  4e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>