More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1508 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 121 aa  240  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 124 aa  157  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  64.46 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  66.12 
 
 		 120 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  63.93 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  68.75 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  64.46 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  61.48 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  63.56 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  60.34 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  70.71 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  63.3 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  62.73 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  62.28 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  66.04 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  67.33 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  59.02 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  62.3 
 
 		 121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  55.91 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  58.33 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  60.19 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  63.55 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0241  ribosomal protein L18  65 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.371166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  59.29 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  59.66 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  63.39 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  63.64 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  62.16 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 		 120 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  53.57 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  56.2 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  64.89 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.97 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>