More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1507 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  100 
 
 
173 aa  344  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  77.42 
 
 
166 aa  240  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  74.84 
 
 
166 aa  239  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  76.13 
 
 
168 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  74.84 
 
 
164 aa  237  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  73.12 
 
 
166 aa  236  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  71.7 
 
 
166 aa  230  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  70.99 
 
 
166 aa  230  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  73.89 
 
 
166 aa  228  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  70.81 
 
 
166 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  224  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  71.25 
 
 
168 aa  224  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  69.75 
 
 
166 aa  223  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  69.38 
 
 
169 aa  222  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  69.38 
 
 
169 aa  222  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  68.75 
 
 
169 aa  221  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  68.1 
 
 
168 aa  220  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  72.15 
 
 
167 aa  220  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  68.94 
 
 
166 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  68.52 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  69.68 
 
 
163 aa  217  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 
162 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  65.84 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  65.82 
 
 
162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  68.39 
 
 
168 aa  210  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 
162 aa  210  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  65.45 
 
 
182 aa  210  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  64.6 
 
 
180 aa  208  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  67.92 
 
 
167 aa  208  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  66.46 
 
 
162 aa  207  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  66.46 
 
 
162 aa  207  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  65.82 
 
 
162 aa  207  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  63.75 
 
 
190 aa  205  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  63.25 
 
 
169 aa  205  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  66.67 
 
 
166 aa  203  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  67.53 
 
 
167 aa  202  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  64.33 
 
 
162 aa  203  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 
179 aa  201  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 
165 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 
165 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  62.58 
 
 
166 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 
172 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  58.93 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  60.9 
 
 
172 aa  195  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  61.01 
 
 
179 aa  195  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 
172 aa  195  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
163 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  61.25 
 
 
172 aa  193  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  60.9 
 
 
172 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.14 
 
 
175 aa  193  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  60.49 
 
 
197 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 
172 aa  192  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  59.74 
 
 
171 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
172 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 
163 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  66.45 
 
 
165 aa  191  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  60.93 
 
 
206 aa  189  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  63.16 
 
 
200 aa  189  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
236 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 
238 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 
163 aa  187  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  57.58 
 
 
168 aa  187  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  56.52 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  62.91 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  62.91 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  62.25 
 
 
166 aa  187  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  56.6 
 
 
174 aa  187  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 
174 aa  186  9e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  61.11 
 
 
172 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  62.34 
 
 
200 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 
169 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  64.94 
 
 
168 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  62 
 
 
182 aa  185  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  59.49 
 
 
215 aa  184  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 
208 aa  184  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 
173 aa  183  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  59.63 
 
 
199 aa  183  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  58.79 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  59.49 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0494  ribosomal protein S5  59.06 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.645622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  60.39 
 
 
210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  65.19 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  60.51 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
222 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  60.67 
 
 
215 aa  180  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  59.38 
 
 
220 aa  180  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
225 aa  180  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>