More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1417 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  75.47 
 
 
452 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  100 
 
 
445 aa  896    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  68.69 
 
 
446 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  65.55 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  67.52 
 
 
453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.14 
 
 
447 aa  601  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  64.02 
 
 
448 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  65.24 
 
 
444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  63.92 
 
 
469 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  63.9 
 
 
446 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  63.34 
 
 
479 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  62.15 
 
 
446 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.5 
 
 
446 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.87 
 
 
447 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  59.5 
 
 
443 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  60.56 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  60.56 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  60.79 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  60.32 
 
 
449 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  60.56 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  60.56 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  60.32 
 
 
449 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  60.32 
 
 
449 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  60.32 
 
 
449 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  60.56 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  60.32 
 
 
449 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  61.02 
 
 
450 aa  521  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  60.52 
 
 
448 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  58.8 
 
 
518 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  57.81 
 
 
455 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  57.81 
 
 
455 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  58.2 
 
 
492 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  57.82 
 
 
451 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  57.34 
 
 
455 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  58.28 
 
 
443 aa  510  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  60.81 
 
 
454 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  60.81 
 
 
454 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  55.58 
 
 
450 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.13 
 
 
452 aa  501  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  57.73 
 
 
463 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  57.11 
 
 
441 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  58.45 
 
 
512 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  58.18 
 
 
449 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  57.44 
 
 
453 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  57.93 
 
 
444 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  54.61 
 
 
449 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  56.82 
 
 
452 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  57.54 
 
 
453 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  57.93 
 
 
444 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  57.37 
 
 
444 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  58.39 
 
 
452 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  58.39 
 
 
452 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  57.86 
 
 
433 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  57.77 
 
 
453 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  53.27 
 
 
508 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  57.18 
 
 
433 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.4 
 
 
512 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  55.13 
 
 
436 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.84 
 
 
481 aa  478  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.98 
 
 
454 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  57.18 
 
 
445 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.28 
 
 
470 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  54.38 
 
 
443 aa  476  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  56.81 
 
 
524 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  56.98 
 
 
447 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  54.02 
 
 
445 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  55.01 
 
 
454 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  54.39 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  54.44 
 
 
476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.22 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  55 
 
 
435 aa  464  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  51.37 
 
 
536 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.24 
 
 
462 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.92 
 
 
551 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  53.92 
 
 
508 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  54.17 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  55.32 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.01 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  53.92 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  56.37 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  55.32 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.14 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.56 
 
 
523 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  54.19 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  53.99 
 
 
459 aa  456  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  53.3 
 
 
521 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  52.69 
 
 
449 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.4 
 
 
449 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.25 
 
 
515 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  53.03 
 
 
517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  51.86 
 
 
521 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  54.93 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  54.93 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  54.25 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  54.93 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.6 
 
 
527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  54.93 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  52.68 
 
 
515 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.57 
 
 
491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  55.42 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>