More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1400 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  56.27 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  51.67 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  51.01 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  46.46 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  51.34 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  51.85 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  51.84 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  52.17 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  52.82 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  49.15 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  46.08 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  51.09 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  47.78 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.27 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  48.65 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  48.83 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 315 aa  234  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  47.65 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  47.14 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  44.52 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  42.76 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  43.85 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.37 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  43.29 
 
 		 320 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  43.92 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.28 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.67 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.28 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.63 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  47.08 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.48 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  44.3 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.81 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 318 aa  208  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  50.35 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  40.07 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  44.92 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.37 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.96 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.62 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.49 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  46.01 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.25 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  43.09 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  46.33 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  41.34 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  38.37 
 
 		 334 aa  198  7e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  42.95 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  41.97 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  44.26 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  48.19 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  44.84 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  45.27 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.75 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.43 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.26 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  42.33 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  43.77 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  43.45 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  43.71 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  49.81 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  47.1 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  42.95 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  42.33 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  47.02 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  46.32 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  44.22 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>