282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1261 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  100 
 
 
209 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  48.1 
 
 
213 aa  198  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  43.75 
 
 
225 aa  185  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  43.78 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  44.44 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  48.8 
 
 
280 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  45.96 
 
 
200 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  45.77 
 
 
247 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  46.24 
 
 
235 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  39.01 
 
 
190 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  43.75 
 
 
218 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  42.77 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  37.57 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  36.36 
 
 
257 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  48 
 
 
493 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  38.05 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  37.38 
 
 
225 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  38.67 
 
 
224 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  41.4 
 
 
230 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  38.97 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.71 
 
 
626 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  39.78 
 
 
220 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  38.25 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  36.87 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  41.52 
 
 
468 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.59 
 
 
489 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  40.25 
 
 
255 aa  129  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  40.85 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  43.31 
 
 
221 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  33.66 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  37.57 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  42.68 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  39.16 
 
 
197 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  41.72 
 
 
224 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
502 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  41.1 
 
 
226 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  45.12 
 
 
221 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  34.93 
 
 
473 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  34.93 
 
 
473 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  44.44 
 
 
249 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  39.76 
 
 
188 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  36.99 
 
 
465 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  34.47 
 
 
470 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  51.33 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  36.99 
 
 
465 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  40 
 
 
306 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  37.86 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  39.17 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  36 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  40.85 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  36.59 
 
 
467 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  39.31 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  39.31 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  39.31 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  39.31 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  39.31 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.14 
 
 
476 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.97 
 
 
800 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  39.04 
 
 
312 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  38.04 
 
 
193 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.26 
 
 
482 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.41 
 
 
480 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  38.75 
 
 
306 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  38.73 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.22 
 
 
473 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  38.36 
 
 
303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  32.92 
 
 
182 aa  115  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  38.73 
 
 
205 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  36 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  36 
 
 
303 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  33.95 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  36 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  39.87 
 
 
457 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  36 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.94 
 
 
480 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.59 
 
 
478 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.73 
 
 
458 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  42.86 
 
 
476 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.76 
 
 
495 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  36.99 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.85 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  29.95 
 
 
203 aa  111  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.59 
 
 
554 aa  111  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  39.87 
 
 
472 aa  111  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.14 
 
 
462 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  34.72 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  42.42 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  36.48 
 
 
303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.96 
 
 
528 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  42.36 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  31.55 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.99 
 
 
472 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  36.99 
 
 
472 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  36.99 
 
 
472 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.37 
 
 
482 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  34 
 
 
459 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  37.34 
 
 
459 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.45 
 
 
487 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  36.48 
 
 
303 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.51 
 
 
462 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>