More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1207 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
399 aa  763    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.68 
 
 
407 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.68 
 
 
407 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.83 
 
 
393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.83 
 
 
393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.42 
 
 
407 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  39.42 
 
 
407 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  38.83 
 
 
407 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  39.15 
 
 
407 aa  255  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.62 
 
 
407 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.2 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  38.35 
 
 
400 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  40.15 
 
 
408 aa  252  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 
412 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  42.04 
 
 
405 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.62 
 
 
399 aa  245  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.62 
 
 
399 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.36 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  38.62 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.1 
 
 
399 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  38.1 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.1 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.1 
 
 
399 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.1 
 
 
399 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  37.83 
 
 
399 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 
411 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  34.55 
 
 
403 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
400 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  33 
 
 
427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 
403 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
414 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 
757 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 
388 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 
409 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.7 
 
 
587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  32.79 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 
586 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
782 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
586 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
586 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
747 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.97 
 
 
587 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 
404 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 
586 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.99 
 
 
585 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
741 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.13 
 
 
415 aa  113  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 
745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.72 
 
 
585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.4 
 
 
386 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 
710 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 
401 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 
585 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
391 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.88 
 
 
585 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 
384 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 
384 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
654 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  35.55 
 
 
387 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
373 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
396 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 
436 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 
384 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.48 
 
 
741 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 
395 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 
777 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  26.47 
 
 
652 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 
441 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 
583 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 
664 aa  93.6  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 
671 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.41 
 
 
540 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 
665 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
673 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
656 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
764 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.03 
 
 
648 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.13 
 
 
649 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.99 
 
 
648 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 
771 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 
649 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.81 
 
 
680 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  29.08 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  26.46 
 
 
648 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  26.46 
 
 
648 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
741 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.77 
 
 
579 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>