More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1194 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  100 
 
 
357 aa  699    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  72.55 
 
 
357 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  69.66 
 
 
354 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  56.2 
 
 
370 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  57.02 
 
 
356 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  56.27 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  55.01 
 
 
359 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  54.34 
 
 
340 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  53.62 
 
 
348 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  53.62 
 
 
348 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  56.19 
 
 
336 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  52.17 
 
 
348 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  54.11 
 
 
357 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  54.29 
 
 
358 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  48.43 
 
 
349 aa  346  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  52.91 
 
 
356 aa  345  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  53.01 
 
 
356 aa  345  7e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  48.55 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  48.84 
 
 
344 aa  338  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  56.47 
 
 
357 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  49.86 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  49.01 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  49.56 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  52.02 
 
 
356 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  48.03 
 
 
355 aa  296  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.14 
 
 
346 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  45.38 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  40 
 
 
367 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  41.83 
 
 
362 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  40 
 
 
360 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.46 
 
 
373 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.34 
 
 
383 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  43.23 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  42.74 
 
 
362 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  40.13 
 
 
374 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  45.24 
 
 
301 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.78 
 
 
361 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.91 
 
 
375 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  39.89 
 
 
361 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  43 
 
 
346 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  38.51 
 
 
357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  41.5 
 
 
355 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  39.61 
 
 
363 aa  222  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  41.36 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  40.23 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  39.66 
 
 
356 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  35.22 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  39.36 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  44.14 
 
 
360 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  37.54 
 
 
347 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  41.98 
 
 
360 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  39.66 
 
 
365 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  35.89 
 
 
356 aa  205  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
356 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  36.75 
 
 
336 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  37.22 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  36.77 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  37.33 
 
 
359 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  38.02 
 
 
352 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  37.06 
 
 
352 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  37.06 
 
 
352 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  37.06 
 
 
352 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.91 
 
 
347 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  37.06 
 
 
352 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  43.98 
 
 
338 aa  196  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
352 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.4 
 
 
330 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  35.61 
 
 
371 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 
352 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.28 
 
 
315 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.75 
 
 
347 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 
352 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.12 
 
 
334 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.05 
 
 
334 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  36.09 
 
 
360 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.05 
 
 
334 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.05 
 
 
334 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  38.37 
 
 
359 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  38.95 
 
 
360 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  38.95 
 
 
360 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  37.1 
 
 
351 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  38.95 
 
 
353 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  37.79 
 
 
359 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.92 
 
 
337 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.57 
 
 
351 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  37.71 
 
 
361 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  38.08 
 
 
359 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  34.52 
 
 
368 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
325 aa  186  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  37.76 
 
 
355 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  37.79 
 
 
359 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  37.79 
 
 
359 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
342 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  36.99 
 
 
312 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  39.52 
 
 
352 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
343 aa  185  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 
342 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>