74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1188 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  100 
 
 
492 aa  971    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  59.55 
 
 
498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  55.62 
 
 
489 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  57.67 
 
 
479 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  55.79 
 
 
473 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  52.18 
 
 
480 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  52.75 
 
 
478 aa  418  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  47.86 
 
 
487 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  46.11 
 
 
493 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  52.24 
 
 
472 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  46.45 
 
 
483 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  67.87 
 
 
239 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  35.51 
 
 
467 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  35.17 
 
 
467 aa  172  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  32.97 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  34.07 
 
 
348 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  31.21 
 
 
436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  31.44 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  30.32 
 
 
473 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  30.72 
 
 
436 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  29.57 
 
 
473 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  32.84 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  30.24 
 
 
445 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  29.81 
 
 
445 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  28.18 
 
 
434 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  27.83 
 
 
418 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  27.69 
 
 
419 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  29.58 
 
 
582 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  32.54 
 
 
450 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  29.7 
 
 
593 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  34.03 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  29.58 
 
 
430 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  26.85 
 
 
580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  30.56 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  28.27 
 
 
611 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  27.4 
 
 
421 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  26.88 
 
 
579 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  28.57 
 
 
579 aa  103  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  32.21 
 
 
379 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  30.14 
 
 
580 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  27.95 
 
 
593 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  28.36 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  31.75 
 
 
375 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  29.28 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  26.47 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  32.41 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  26.55 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  25.08 
 
 
357 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  25.19 
 
 
369 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  28.93 
 
 
343 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  26.49 
 
 
331 aa  54.7  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  26.01 
 
 
360 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  27.45 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  26.33 
 
 
360 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  27.15 
 
 
360 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  22.38 
 
 
374 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  28.42 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  21.24 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  23.83 
 
 
339 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  21.3 
 
 
335 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  22.95 
 
 
357 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  25.29 
 
 
346 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  26.09 
 
 
352 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  26.29 
 
 
369 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  23.68 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  25.28 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  25.83 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  30.38 
 
 
369 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  21.86 
 
 
338 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  33.1 
 
 
347 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  23.89 
 
 
365 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  22.06 
 
 
411 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  24.74 
 
 
365 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>