162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1170 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
329 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  53 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  52.81 
 
 
328 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  50 
 
 
326 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  50 
 
 
326 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  49.33 
 
 
331 aa  292  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  47.56 
 
 
329 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  49.2 
 
 
335 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  45.15 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  44.24 
 
 
326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  43.6 
 
 
333 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  44.07 
 
 
334 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  43.43 
 
 
337 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  44.34 
 
 
349 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  47.96 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  43.16 
 
 
334 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  47.96 
 
 
327 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  46.28 
 
 
334 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  45.61 
 
 
334 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  44.81 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  43.87 
 
 
355 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  46.9 
 
 
325 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  42.53 
 
 
327 aa  242  6e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  43.96 
 
 
349 aa  241  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  44.59 
 
 
324 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  45.37 
 
 
329 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  42.9 
 
 
327 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  43.87 
 
 
351 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  42.77 
 
 
346 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  42.64 
 
 
351 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  43.87 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  43.87 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  42.99 
 
 
347 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  42.63 
 
 
354 aa  232  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  40.72 
 
 
329 aa  229  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  43.13 
 
 
357 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  43.31 
 
 
368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  40.25 
 
 
368 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  37.81 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  40.97 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  42.86 
 
 
352 aa  211  9e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  44.07 
 
 
376 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  26.41 
 
 
212 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2569  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  32.54 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.5 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1881  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.62 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0817  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  30.46 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  34.43 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0873  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.3 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0404  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.97 
 
 
436 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0639717  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1486  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.97 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000391444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.01 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0737  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  25.45 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4116  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.66 
 
 
402 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72585  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  29.73 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1496  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.66 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  33.91 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.69 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273783  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1492  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.02 
 
 
375 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  32.17 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0710  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.67 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3962  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.66 
 
 
402 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1602  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.95 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1347  normal  0.338621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4464  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.89 
 
 
410 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10440  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.35 
 
 
407 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  27.09 
 
 
213 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.65 
 
 
407 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2184  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.04 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.414855  normal  0.985413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00980  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  27.08 
 
 
396 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18950  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.58 
 
 
385 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.619204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13040  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  34.31 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4029e-26  decreased coverage  0.000450672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0690  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.63 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.253625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6834  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.76 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.560399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0792  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.78 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.548786  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14800  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.67 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.33 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3037  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.36 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0151115  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0987  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.71 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243634  decreased coverage  0.00000758773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0695  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.66 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2170  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.11 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.84 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0345037  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  31.3 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2662  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.77 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2244  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.7 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4096  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.48 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0972824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3073  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.7 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0208  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  34.51 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.203625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0953  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.57 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.05 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.05 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1976  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.35 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4577  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.17 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.969326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  34.21 
 
 
436 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  29.57 
 
 
296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1944  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.66 
 
 
397 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0773  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.98 
 
 
376 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3189  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.32 
 
 
399 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.438371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  28.87 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  29.94 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0814  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.03 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.492528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>