116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1080 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.85 
 
 
667 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.06 
 
 
657 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  68.61 
 
 
634 aa  912    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.15 
 
 
663 aa  636    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  69.1 
 
 
625 aa  892    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  69.15 
 
 
624 aa  885    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  69.45 
 
 
629 aa  872    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.22 
 
 
658 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
635 aa  1323    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.13 
 
 
658 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.86 
 
 
662 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.32 
 
 
665 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.17 
 
 
664 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.17 
 
 
664 aa  618  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.66 
 
 
673 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.03 
 
 
659 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.61 
 
 
635 aa  572  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.48 
 
 
627 aa  550  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.97 
 
 
629 aa  545  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  45.16 
 
 
632 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.78 
 
 
622 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.24 
 
 
622 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  35 
 
 
574 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.91 
 
 
590 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.17 
 
 
591 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.17 
 
 
579 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.91 
 
 
594 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.58 
 
 
566 aa  292  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  30.89 
 
 
563 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  27.23 
 
 
569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  27.36 
 
 
574 aa  173  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  27.36 
 
 
574 aa  173  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  27.03 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  26.59 
 
 
574 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  26.74 
 
 
574 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  26.65 
 
 
578 aa  151  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  26.43 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.6 
 
 
579 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
579 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  25.48 
 
 
579 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.76 
 
 
578 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  26.08 
 
 
579 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
579 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  25.9 
 
 
578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.08 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  25.16 
 
 
954 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.17 
 
 
583 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.63 
 
 
556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  24.49 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  24.36 
 
 
573 aa  107  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.07 
 
 
610 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
641 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.58 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.23 
 
 
573 aa  70.1  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  20.25 
 
 
601 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.05 
 
 
612 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.51 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.11 
 
 
605 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.9 
 
 
612 aa  57  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.7 
 
 
597 aa  54.7  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.2 
 
 
598 aa  54.3  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.12 
 
 
581 aa  53.9  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  22.71 
 
 
584 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.45 
 
 
604 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.22 
 
 
595 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.94 
 
 
582 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.19 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  20.53 
 
 
534 aa  51.2  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  20.25 
 
 
576 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.37 
 
 
575 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.91 
 
 
595 aa  50.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.66 
 
 
605 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.69 
 
 
611 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.66 
 
 
605 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  20.37 
 
 
532 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.88 
 
 
570 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.73 
 
 
605 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0976  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.23 
 
 
600 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.86 
 
 
611 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  20.12 
 
 
579 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2636  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.23 
 
 
600 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  20.87 
 
 
531 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  20.61 
 
 
531 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.08 
 
 
604 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  23.08 
 
 
528 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.52 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.83 
 
 
566 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.54 
 
 
606 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3690  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.45 
 
 
613 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  20.23 
 
 
542 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  19.96 
 
 
607 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.84 
 
 
596 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.14 
 
 
591 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3978  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.16 
 
 
613 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.23 
 
 
599 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>