59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0973 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  100 
 
 
334 aa  684    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  50.48 
 
 
302 aa  295  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  50.97 
 
 
301 aa  278  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.22 
 
 
293 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  48.33 
 
 
319 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.77 
 
 
302 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.18 
 
 
314 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  41.45 
 
 
292 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  37.66 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.91 
 
 
318 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.13 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.28 
 
 
318 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.83 
 
 
303 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.23 
 
 
321 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.83 
 
 
299 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.53 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.71 
 
 
359 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  28.45 
 
 
356 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.97 
 
 
306 aa  125  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.74 
 
 
340 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.13 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.98 
 
 
313 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  27.73 
 
 
316 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  30.53 
 
 
301 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.53 
 
 
302 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  32.81 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.03 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.16 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.63 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.57 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.66 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.31 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.7 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.38 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  28.38 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.86 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  28.43 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.07 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.7 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.32 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.07 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.38 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.5 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.71 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.96 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.21 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.09 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.15 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  27.31 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  28.15 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  28.72 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  25 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  27.01 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  29.65 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  36.05 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.13 
 
 
294 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  34.74 
 
 
366 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.11 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  26.62 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>