More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0968 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  100 
 
 
392 aa  785    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  54.59 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  52.58 
 
 
395 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  50.51 
 
 
415 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  49.49 
 
 
389 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  45.41 
 
 
391 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  45.41 
 
 
391 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  45.78 
 
 
391 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  50.39 
 
 
397 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  46.89 
 
 
391 aa  360  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  46.63 
 
 
391 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  47.04 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  45.64 
 
 
390 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  45.78 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  48.21 
 
 
413 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  45.27 
 
 
394 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  44.79 
 
 
392 aa  346  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  45.34 
 
 
400 aa  345  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  46.27 
 
 
409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  45.95 
 
 
394 aa  340  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  48.81 
 
 
391 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  45.13 
 
 
411 aa  332  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  46.17 
 
 
396 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  44.25 
 
 
394 aa  329  6e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  43.64 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  46.56 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  47.35 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  43.7 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  43.39 
 
 
404 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  47.09 
 
 
389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  43.39 
 
 
404 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  43.85 
 
 
397 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  43.44 
 
 
396 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  43.39 
 
 
404 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  41.62 
 
 
397 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  47.09 
 
 
389 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  45.34 
 
 
416 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  44.47 
 
 
396 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  43.15 
 
 
397 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  46.84 
 
 
397 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  44.53 
 
 
397 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  42.93 
 
 
393 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  44.47 
 
 
396 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  44.27 
 
 
397 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  43.44 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  44.47 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  44.47 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  42.89 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  42.89 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  44.47 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  42.89 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  43.44 
 
 
396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  43.19 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  42.64 
 
 
398 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  47.94 
 
 
389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  44.44 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  44.19 
 
 
400 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  43.48 
 
 
394 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  42.64 
 
 
393 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  43.69 
 
 
400 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  43.52 
 
 
396 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  41.9 
 
 
396 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  41.9 
 
 
396 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  41.9 
 
 
396 aa  315  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  43.19 
 
 
393 aa  315  8e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  41.57 
 
 
425 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  41.39 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  42.46 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  40.81 
 
 
423 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  41.9 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  41.9 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  41.65 
 
 
396 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  41.77 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  41.65 
 
 
396 aa  308  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  41.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  43.94 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  41.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  41.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  41.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  41.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  41.65 
 
 
396 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  41.65 
 
 
396 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  41.39 
 
 
396 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  40.77 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  42.49 
 
 
403 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  42.49 
 
 
403 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  42.49 
 
 
403 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  42.49 
 
 
403 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 
403 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  43.41 
 
 
393 aa  305  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  41.93 
 
 
391 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  44.81 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  41.03 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  41.41 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  40.66 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  41.43 
 
 
418 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  41.56 
 
 
396 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  39.49 
 
 
395 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  40.05 
 
 
394 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  40.52 
 
 
390 aa  296  5e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>